Качественный чехол можно носить постоянно, он не навредит ноутбуку. Главное чтобы он не мешал вентиляции и не создавал дополнительного тепла. Дома можно и снять для лучшего охлаждения.
Я свой MacBook практически не вынимаю из чехла - только когда нужно почистить. Пользуюсь уже больше года, никаких проблем нет. Чехол выбирал тщательно, в итоге остановился на варианте из этого каталога https://blackpink.com.ua/chekhly-na-mac/. Он позволяет ноутбуку нормально 'дышать' и не создает лишнего тепла.